La uva utilizada procede de viñedos situados en la localidad de Pedrosa de Duero, en Burgos. Se trata de unas 135 hectáreas situadas a una altitud media de 840 metros. Las cepas cuentan con edades comprendidas entre los 20 y los 35 años; los suelos son de tipo arcillo-calcáreo y el clima de la zona es continental, aunque presenta considerables influencias atlánticas.
La vendimia de los granos de Viña Pedrosa La Navilla se realiza de forma manual y el vino se vinifica siguiendo los preceptos de la elaboración tradicional. La Navilla reposa durante 20 meses en barricas de roble francés antes de ser embotellado y comercializado.